Top 5 mejores sistemas POS para farmacia en México [2026]

El mejor sistema de punto de venta para una farmacia en México es el que controla lotes y fechas de caducidad de forma nativa, registra recetas médicas en cada venta, emite CFDI 4.0 automáticamente y cumple con la normativa COFEPRIS sin procesos manuales. Con Pulpos puedes hacer todo eso desde la nube, sin instalar nada ni depender de un técnico local. Actualizado junio 2026.

En este artículo:

¿Qué necesita el POS de una farmacia que no necesita una tienda normal?

Criterios para evaluar un sistema POS de farmacia (los 6 que importan)

Tabla comparativa: los 5 mejores sistemas POS para farmacia en México

1. Pulpos — el POS en la nube con control de lotes y CFDI para farmacias que crecen

2. SICAR — el sistema legacy con base instalada entre farmacéuticos

3. SIFO — opción de bajo costo con funcionalidades de farmacia

4. Eleventa — el sistema más adoptado en farmacias de un solo local

5. PharmacyLite (BISOFT) — software especializado para farmacias

¿Cómo elegir el sistema correcto para tu farmacia?

¿Pulpos sirve para mi farmacia? Lo que sí hace y lo que debes saber

Preguntas frecuentes

México tiene más de 62,538 farmacias registradas ante el INEGI — y la gran mayoría son independientes o pequeñas cadenas, no Farmacias del Ahorro ni Benavides. Son negocios como el de Jorge Méndez, que tiene dos farmacias en Guadalajara y lleva siete años operando. En su primer inventario físico con sistema detectó un faltante de $8,000 en medicamentos controlados que no había podido rastrear antes.

Si todavía llevas los lotes en un cuaderno o confías en la memoria para saber qué va a caducar la próxima semana, este artículo es para ti. A continuación encontrarás una comparativa honesta de los 5 sistemas más usados en farmacias mexicanas, con una tabla de criterios específicos del giro y una guía para elegir según tu perfil.

Antes de ver los sistemas, vale la pena entender por qué elegir un POS de farmacia no es lo mismo que elegir cualquier software de ventas. Si ya lo sabes, salta directo a la tabla comparativa.

¿Qué necesita el POS de una farmacia que no necesita una tienda normal?

Una farmacia vende salud, no ropa ni ferretería. Eso cambia todo en el sistema.

En cualquier otro giro, si el inventario descuadra unos días, el impacto es económico. En una farmacia, el impacto puede ser regulatorio: COFEPRIS puede solicitarte en cualquier momento un reporte de trazabilidad de antibióticos, y si no puedes generarlo, las consecuencias van más allá de una multa. Según el Reglamento de Insumos para la Salud y la NOM-072, los medicamentos regulados requieren trazabilidad de lote en cada venta.

Estas son las funcionalidades que un POS de farmacia necesita — y que un sistema genérico de ventas normalmente no tiene:

Control de lotes y caducidades nativo: no como un módulo extra, sino integrado al flujo de venta. Cada vez que se vende un medicamento, el sistema descuenta automáticamente del lote correcto y actualiza la fecha de caducidad vigente.

Registro de recetas médicas en la venta: para antibióticos y productos controlados, el sistema debe poder marcar qué productos requieren receta y registrarla al momento de vender.

IVA 0% en medicamentos: los medicamentos del catálogo SAT tienen tasa 0%. Si el sistema no lo calcula solo, cada venta es un riesgo de error fiscal que puede acumularse rápido.

CFDI 4.0 automático con datos de lote: la factura no es solo el comprobante — para aseguradoras y auditorías, el número de lote en el CFDI es la prueba de trazabilidad.

Reportes de caducidad y stock regulatorio: para pasar una auditoría COFEPRIS necesitas saber de inmediato qué productos están por vencer y cuántos quedan en qué lote.

El 47% de las PyMEs en México todavía lleva procesos administrativos de forma manual. En farmacias independientes, esa brecha tiene un costo regulatorio que no tienen otras industrias. Ahora que tienes claro qué hace diferente a este giro, veamos cómo evaluar cada sistema con los criterios correctos.

Criterios para evaluar un sistema POS de farmacia en México (los 6 que importan)

No todos los criterios pesan igual. Un sistema que funciona bien para una abarrotería puede fallar en una farmacia desde el primer día de auditoría. Estos son los 6 criterios que debes revisar antes de decidir:

Control de lotes y caducidades integrado al POS: no es suficiente que el sistema «soporte caducidades» como dato. El lote debe descontarse automáticamente en cada venta, aplicar PEPS (lo más antiguo primero) y generar alertas de productos próximos a vencer sin que tengas que correr reportes manualmente.

Registro de recetas médicas en la venta: antibióticos del catálogo COFEPRIS y medicamentos controlados requieren registro de receta. El sistema debe permitirte marcar productos que necesitan receta y registrarla en el ticket o CFDI.

CFDI 4.0 nativo con actualización SAT automática: los catálogos del SAT cambian. Si tu sistema requiere que descargues actualizaciones manualmente, cada cambio es un punto de fallo. El CFDI con datos de lote incluidos es un diferenciador importante para farmacias que venden a aseguradoras o a empresas.

Tipo de arquitectura: nube vs instalado: los sistemas instalados funcionan sin internet, pero te atan a una PC específica y no te permiten ver tu farmacia desde el celular ni gestionar varias sucursales desde un solo punto. Los sistemas en la nube requieren conexión, pero te dan visibilidad en tiempo real desde cualquier dispositivo.

Multi-sucursal real: si tienes o planeas tener más de un punto, necesitas que el sistema te muestre el inventario de todas tus sucursales desde una sola pantalla, no que cada local opere como isla.

Precio y modelo: los sistemas instalados suelen cobrar una vez y luego cobrar por actualizaciones del SAT. Los sistemas en la nube cobran mensualidad pero incluyen actualizaciones automáticas. La pregunta no es cuál es más barato el primer año, sino cuánto cuesta el total en 3 años incluyendo soporte y actualizaciones.

Con estos criterios en mente, la tabla comparativa tiene más sentido. Aquí están los 5 sistemas.

Tabla comparativa: los 5 mejores sistemas POS para farmacia en México

La tabla usa los criterios del giro farmacéutico — no los genéricos de cualquier comparativa de POS. Para el detalle completo de cada sistema, lee las fichas individuales debajo.

Sistema | Tipo | Precio aprox. | Lotes y caducidades | Recetas médicas | CFDI 4.0 nativo | Multi-sucursal | Para quién conviene
Pulpos | Nube | Ver precios → | Nativo + masivo | Nativo | Automático | En la nube | Farmacias con 1-3 sucursales que quieren visibilidad remota y CFDI integrado
SICAR | Instalado | De pago (cotización) | Soportado | Soportado | Manual | Solo red local | Farmacias de un solo local con soporte SICAR local establecido
SIFO | Instalado | De pago (pago único) | Soportado | Soportado | Timbres extra | Solo red local | Farmacias de un solo local en zonas con conectividad inestable
Eleventa | Instalado | De pago (pago único) | Soportado | Básico | Manual | Solo red LAN | Farmacias pequeñas que priorizan facilidad de uso y bajo costo de entrada
PharmacyLite | Híbrido (local + nube) | De pago (cotización) | Especializado | Con módulo consultorio | Verificar | Solo reportes remotos | Farmacias que priorizan profundidad farmacéutica y operación sin internet

Ahora el detalle de cada uno.

1. Pulpos — el POS en la nube con control de lotes y CFDI para farmacias que crecen

Pulpos es un sistema de punto de venta en la nube hecho en México para comerciantes que ya operan con cierta complejidad. Para farmacias, el diferenciador central es que combina control de lotes y caducidades, registro de recetas médicas y facturación CFDI 4.0 en una sola plataforma, sin necesidad de instalar nada ni contratar un técnico local. Con el sistema de punto de venta Pulpos para farmacias puedes gestionar el mostrador, el inventario por lotes y la facturación desde el mismo lugar.

Lo que Pulpos hace bien en una farmacia

Control de lotes y caducidades nativo: cada medicamento se registra con su número de lote y fecha de caducidad. Al vender, el sistema descuenta automáticamente del lote más antiguo (PEPS). Puedes hacer carga masiva de lotes desde Excel y activar la inclusión de datos de lote en el CFDI.

Registro de recetas médicas: con Pulpos puedes marcar los productos que requieren receta médica. Al vender ese producto, el sistema te pide registrarla antes de cerrar la venta.

CFDI 4.0 automático en cada venta: la factura sale integrada al punto de venta, sin abrir otro programa. El SAT actualiza catálogos automáticamente. No necesitas comprar timbres por separado.

Acceso desde cualquier dispositivo: como es un sistema en la nube, puedes ver el inventario de tus sucursales desde el celular, generar reportes de caducidad y revisar cómo va cada caja sin necesitar estar físicamente en la farmacia.

Soporte en español por WhatsApp: el equipo de Pulpos responde en español. Para farmacias que no tienen equipo de TI interno, esto importa.

Lo que debes considerar

Requiere internet: Pulpos es un sistema en la nube y necesita conexión para operar. Si tu farmacia está en una zona con internet inestable, necesitas un plan de contingencia — la recomendación es tener el hotspot del celular listo como respaldo.

No es un sistema 100% especializado en farmacia: Pulpos sirve a más de 24 giros distintos. Para farmacias con necesidades muy específicas de cumplimiento COFEPRIS (como módulo de consultorio integrado o base de datos PLM con principios activos), un sistema especializado como PharmacyLite puede tener más profundidad en esos puntos.

¿Quieres configurar el control de lotes y caducidades en Pulpos? Consulta el paso a paso completo en nuestro centro de ayuda sobre lotes y caducidades.

Tip de Pulpos: Puedes activar la opción de incluir el número de lote directamente en el CFDI. Esto te permite entregar facturas con trazabilidad completa a aseguradoras y clientes empresariales sin trámites manuales adicionales.

Pulpos tiene prueba gratis de 14 días, sin tarjeta de crédito. Los planes escalan desde una sola caja hasta varias sucursales.

2. SICAR — el sistema legacy con base instalada entre farmacéuticos

SICAR es un software instalado en Windows con más de 40 años en el mercado mexicano. Tiene base instalada importante entre negocios establecidos en distintos giros, incluyendo farmacias. Su red de distribuidores locales y soporte técnico presencial es una de sus fortalezas más citadas por usuarios que llevan años con el sistema.

Fortalezas de SICAR en farmacias

Base instalada y red de soporte: tiene distribuidores en muchas ciudades del país con soporte presencial.

Funciona sin internet: los datos viven en la computadora local, lo que es una ventaja real en zonas con conectividad inestable.

Funcionalidades de farmacia: soporta control de recetas y productos controlados, así como buscador por sustancia activa.

Software estable para operaciones de mostrador: probado en entornos de alta rotación.

Limitaciones de SICAR

Software legacy de escritorio: no es un sistema en la nube. No puedes ver tus sucursales desde el celular sin estar conectado a la red local del negocio.

Multi-sucursal solo en red local: si tus farmacias están en ubicaciones distintas, no puedes ver el inventario consolidado desde una sola pantalla sin instalar infraestructura de red.

Actualizaciones del SAT manuales: los catálogos de CFDI requieren descarga e instalación manual. Cada actualización es un punto de fricción operativa.

Para quién sí sirve: farmacias de un solo local que ya tienen SICAR instalado, soporte local establecido y sin necesidad de acceso remoto. Si el sistema funciona y el negocio no planea expandirse, la fricción de cambio puede no valer la pena.

Para quién no sirve: farmacias con 2 o más sucursales en ubicaciones distintas, o que necesitan ver el negocio desde el celular y operar con CFDI sin procesos manuales.

3. SIFO — opción de precio bajo con funcionalidades de farmacia

SIFO es otro sistema instalado en Windows con versión SIFO Nube para reportes remotos. Tiene historia en el giro farmacéutico y en carnicerías. Su modelo de pago único lo hace atractivo para negocios que prefieren evitar mensualidades.

Fortalezas de SIFO

Precio de entrada bajo: modelo de pago único sin mensualidad.

Funciona sin internet: los datos son locales, ventaja en zonas con conectividad irregular.

Funcionalidades específicas de farmacia: soporta recetas médicas y funciones para productos regulados.

Limitaciones de SIFO

SIFO Nube solo permite consultas remotas: no puedes operar desde otra ubicación — solo ver reportes.

Timbres fiscales con costo adicional: después del primer año, la facturación tiene costo extra por timbre.

Sin app móvil funcional para ventas: la operación es principalmente desde PC Windows.

Multi-sucursal limitado a red local: igual que SICAR, las sucursales en distintas ubicaciones no se consolidan de forma nativa.

Para quién sí sirve: farmacias de un solo local que priorizan bajo costo inicial, operan en zonas con internet inestable y no necesitan tienda en línea ni acceso remoto.

Para quién no sirve: farmacias con más de un local o que quieren proyectar el negocio a la nube en el corto o mediano plazo.

4. Eleventa — el sistema más adoptado en farmacias de un solo local en México

Eleventa es uno de los sistemas de punto de venta más adoptados en México para negocios de un solo local: abarrotes, papelerías, farmacias pequeñas. Su modelo de pago único y su facilidad de uso son sus principales ventajas de entrada.

Fortalezas de Eleventa

Muy fácil de usar: adoptado masivamente en negocios sin experiencia técnica.

Precio bajo de entrada: pago único, sin mensualidad.

Funciona sin internet: base de datos local en la computadora.

Rapidez de cobro en mostrador: flujo de venta sencillo y rápido.

Limitaciones de Eleventa

Arquitectura de escritorio Windows: no es un sistema en la nube real.

Multi-sucursal solo en red LAN: sin visibilidad remota entre ubicaciones distintas.

App móvil solo de consulta: no procesa ventas desde el celular.

Actualizaciones SAT manuales: los catálogos de CFDI deben descargarse manualmente.

Funcionalidades de recetas médicas básicas: para farmacias con volumen alto de antibióticos y controlados, puede ser insuficiente.

Para quién sí sirve: farmacias pequeñas con una caja, que priorizan facilidad de uso y bajo costo de arranque, y no requieren visibilidad entre ubicaciones ni tienda en línea.

Para quién no sirve: farmacias que necesitan multi-sucursal real, acceso desde el celular o profundidad en control regulatorio de medicamentos controlados.

5. PharmacyLite (BISOFT) — software especializado para farmacias con 30 años en el mercado

PharmacyLite es el producto de BISOFT para farmacias independientes y pequeñas cadenas. Con 30 años de operación exclusiva en el sector farmacéutico, es el sistema con mayor profundidad vertical de esta lista. Su arquitectura es híbrida: el punto de venta corre instalado en Windows, y tiene un concentrador en la nube para reportes y supervisión multi-sucursal.

Fortalezas de PharmacyLite

Especialización total en farmacia: construido exclusivamente para este giro, no un POS genérico adaptado.

Control de lotes y caducidades con alertas: avisa de productos próximos a vencer y soporta trazabilidad de antibióticos y controlados para reportes COFEPRIS.

Base de datos PLM integrada: incluye información farmacológica (principio activo, imágenes, contraindicaciones) actualizada por BISOFT.

Módulo Consultorio: agrega consultas médicas al flujo de venta; las recetas se cargan automáticamente al POS por folio.

Funciona sin internet: el POS opera offline y sincroniza al restablecer la conexión (intervalos de 15 minutos).

Precios Máximos Permisibles (PMP): actualización automática de los precios regulados por el gobierno.

Limitaciones de PharmacyLite

Arquitectura híbrida, no nube nativa: el POS vive en la máquina local Windows; el concentrador remoto es solo para reportes, no para operar desde otra ubicación.

Sin tienda en línea integrada: no tiene catálogo digital propio conectado al inventario.

Sin app móvil de punto de venta: la app móvil es solo para inventarios, no procesa ventas.

Módulo Consultorio tiene costo adicional: el precio total incluye varios módulos separados.

Para quién sí sirve: farmacias independientes o pequeñas cadenas que necesitan profundidad farmacéutica (COFEPRIS, PLM, recetas, PMP), que operan en zonas con internet inestable y no tienen necesidad de vender en línea o gestionar múltiples giros.

Para quién no sirve: farmacias que quieren acceder al sistema desde cualquier dispositivo sin instalar nada, vender en línea, o integrar canales más allá del mostrador físico. Tampoco si el negocio combina farmacia con otro giro.

¿Quieres ver cómo se comparan Pulpos y PharmacyLite punto por punto? Consulta la comparativa oficial Pulpos vs PharmacyLite.

¿Cómo elegir el sistema correcto para tu farmacia? — recomendación condicional

No existe un sistema universalmente mejor. Existe el correcto para tu perfil. Antes de decidir, respóndete estas preguntas:

¿Cuántas sucursales tienes o planeas tener? Si son o serán 2 o más en distintas ubicaciones, los sistemas instalados se van a quedar cortos desde el primer día.

¿Necesitas ver tu farmacia desde el celular sin estar ahí? Solo los sistemas en la nube lo permiten.

¿Tu zona tiene internet estable? Si hay cortes frecuentes de conectividad, un sistema instalado como es más robusto para tu operación diaria.

¿Cuánta profundidad farmacéutica necesitas? Si el núcleo de tu negocio es medicamentos controlados, consultorio médico y PLM, PharmacyLite tiene más profundidad específica. Si también manejas OTC, artículos de papelería o parafarmacia, un sistema general como Pulpos puede ser más flexible.

¿Qué modelo de costo prefieres? Pago único vs mensualidad no es solo una pregunta financiera — también define quién mantiene el sistema actualizado con el SAT.

¿Pulpos sirve para mi farmacia? Lo que sí hace y lo que debes saber

Si llegaste hasta aquí con interés en Pulpos, aquí está la respuesta directa a lo que más preguntan los farmacéuticos propietarios antes de hacer la prueba.

Con Pulpos puedes gestionar el control de inventario para farmacia con lotes, caducidades y alertas, registrar recetas médicas en la venta, emitir CFDI 4.0 en cada transacción y ver el estado de todas tus farmacias desde el celular sin necesitar estar en el local.

Lo que Pulpos hace para farmacias:

Configura tus medicamentos con número de lote y fecha de caducidad — puedes hacerlo uno por uno o cargar de forma masiva desde Excel.

Marca los productos que requieren receta médica — al vender ese artículo, el sistema solicita el registro antes de cerrar la venta.

Emite CFDI 4.0 integrado en cada venta — sin abrir otro programa ni comprar timbres extra.

Genera reportes de inventario por lote y caducidad — para que siempre sepas qué va a vencer en los próximos días.

Conecta tus sucursales en una sola vista — si tienes más de una farmacia, ves el inventario consolidado desde el mismo sistema.

Lo que debes tener en cuenta: Pulpos requiere internet para operar. Si tu zona tiene cortes frecuentes de conexión, necesitas el hotspot del celular como respaldo. La mejor experiencia de las funcionalidades más completas es desde la versión web en computadora, aunque la app móvil está disponible.

¿Quieres ver cómo registrar la venta de un producto con receta médica paso a paso? Consulta el artículo en nuestro centro de ayuda sobre recetas médicas.

En resumen:

Una farmacia necesita control de lotes y caducidades, registro de recetas médicas, IVA 0% automático en medicamentos y CFDI 4.0 — requisitos que la mayoría de los sistemas genéricos no cubren de forma nativa.

Los sistemas instalados (SICAR, SIFO, Eleventa) funcionan sin internet y tienen bajo costo de entrada, pero limitan la visibilidad multi-sucursal y las actualizaciones del SAT son manuales.

PharmacyLite es el más especializado en profundidad farmacéutica (PLM, COFEPRIS, consultorio), pero su arquitectura es híbrida, no nube nativa, y el precio requiere cotización.

Pulpos es la única opción en la nube que integra lotes y caducidades, recetas, CFDI 4.0 y multi-sucursal sin instalación local — ideal para farmacias con 1-3 sucursales que quieren escalar sin cambiar de sistema.

Conoce Pulpos para farmacias y pruébalo gratis 14 días, sin tarjeta de crédito.

Preguntas frecuentes

¿Cuál es el mejor sistema de punto de venta para una farmacia en México?

No hay una sola respuesta: depende de si necesitas multi-sucursal, si tu zona tiene internet estable y qué tan profundo es tu requerimiento regulatorio. Para farmacias con 1-3 sucursales que necesitan control de lotes, recetas médicas, CFDI 4.0 automático y visibilidad remota, Pulpos integra todo eso desde la nube sin instalar nada. Para farmacias de un solo local con internet inestable, SICAR o SIFO son opciones sólidas. Para quienes necesitan la mayor profundidad farmacéutica (PLM, consultorio, PMP), PharmacyLite es el más especializado.

¿Qué sistema me ayuda a cumplir con los requisitos de COFEPRIS en mi farmacia?

COFEPRIS requiere trazabilidad de lote en antibióticos y medicamentos controlados, reportes de caducidad y registro de recetas en la venta. Los sistemas que cubren esto de forma más completa son PharmacyLite (con módulo COFEPRIS especializado) y Pulpos (con control de lotes nativo, registro de recetas y lote en el CFDI). Antes de decidir, valida con cada proveedor que sus reportes de trazabilidad son compatibles con el formato que COFEPRIS solicita en auditorías.

¿Cómo manejo recetas médicas en el sistema de punto de venta de mi farmacia?

En Pulpos puedes marcar cada producto que requiere receta médica en la configuración del catálogo. Al intentar venderlo, el sistema te pide registrar la receta antes de cerrar la venta. El registro queda en el historial de la transacción. Para antibióticos y controlados, esto te da el respaldo necesario ante una revisión. El proceso de configuración toma minutos desde el catálogo del sistema.

¿Cómo registro la venta de medicamentos controlados en mi sistema de farmacia?

El flujo correcto es: (1) el medicamento debe estar marcado en el sistema como producto con receta obligatoria, (2) al venderse, el cajero registra el número de receta o el folio según el protocolo de tu farmacia, (3) el sistema asocia ese registro a la venta y al lote. Con ese flujo, si COFEPRIS solicita el historial de un medicamento controlado puedes generarlo desde los reportes del sistema. En Pulpos ese flujo está disponible con el módulo de recetas médicas.

¿El IVA 0% en medicamentos lo hace el sistema solo o lo tengo que configurar yo?

Depende del sistema. En Pulpos, puedes configurar la tasa de IVA por producto al darlos de alta en el catálogo — los medicamentos del catálogo SAT con tasa 0% se configuran con esa tasa y el sistema la aplica automáticamente en cada venta. Eso significa que no tienes que recordar qué lleva IVA y qué no en cada transacción: el sistema lo hace solo una vez que configuras el catálogo correctamente. Antes de arrancar, verifica con tu contador qué productos aplican para tasa 0% y cuáles llevan IEPS.

Tengo una farmacia, ¿qué sistema POS me conviene más: SICAR o algo en la nube?

Si tienes una sola farmacia, internet estable y ya tienes soporte de SICAR funcionando, puede no valer la pena cambiar por el momento. Si tienes o planeas tener 2 o más farmacias, o quieres ver el negocio desde el celular sin estar físicamente en el local, un sistema en la nube como Pulpos te da capacidades que SICAR no puede ofrecer con su arquitectura instalada. La decisión clave es si tu modelo de negocio requiere visibilidad remota ahora o en el corto plazo.

Fuentes

INEGI DENUE 2024 — Farmacias en México

ANFAD / INEGI ENAPROCE 2023 — Adopción tecnológica en PyMEs

COFEPRIS — Normativa para farmacias en México